Changes

              
    

          
          
        
        

            
f
1
{
f
1
{
            
2
  "author": "Mark Hudson & Ricardo Fernandes",
2
  "author": "Mark Hudson & Ricardo Fernandes",
            
3
  "author_email": "hudson@shh.mpg.de",
3
  "author_email": "hudson@shh.mpg.de",
            
4
  "creator_user_id": "a529d3d6-d77a-4797-b965-a00f60123108",
4
  "creator_user_id": "a529d3d6-d77a-4797-b965-a00f60123108",
            
5
  "doi": "10.48493/jyvf-5a27",
5
  "doi": "10.48493/jyvf-5a27",
            
6
  "ext_doi": "",
6
  "ext_doi": "",
            
7
  "gen": [
7
  "gen": [
            
8
    "yes"
8
    "yes"
            
9
  ],
9
  ],
            
10
  "groups": [
10
  "groups": [
            
11
    {
11
    {
            
n
12
      "description": "The IsoMemo group list datasets created by 
n
12
      "description": "IsoMemo is a network of autonomous isotopic 
            
13
IsoMemo partners. Both those that are stored internally within Pandora 
13
databases.",
            
14
and those that are stored externally.",

            
15
      "display_name": "IsoMemo group",
14
      "display_name": "IsoMemo Network",
            
16
      "id": "1739bd12-4cd3-48eb-8658-c1d470d0f965",
15
      "id": "1739bd12-4cd3-48eb-8658-c1d470d0f965",
            
17
      "image_display_url": 
16
      "image_display_url": 
            
n
18
s://pandoradata.earth/uploads/group/2021-03-30-175014.746487logo.jpg",
n
17
s://pandoradata.earth/uploads/group/2021-07-30-232325.731205logo.jpg",
            
19
      "name": "isomemo-group",
18
      "name": "isomemo-group",
            
n
20
      "title": "IsoMemo group"
n
19
      "title": "IsoMemo Network"
            
21
    }
20
    }
            
22
  ],
21
  ],
            
23
  "id": "8378ee13-0cb9-4fec-95aa-d64f52d21fd0",
22
  "id": "8378ee13-0cb9-4fec-95aa-d64f52d21fd0",
            
24
  "isopen": true,
23
  "isopen": true,
            
25
  "license_id": "cc-by-sa",
24
  "license_id": "cc-by-sa",
            
26
  "license_title": "Creative Commons Attribution Share-Alike",
25
  "license_title": "Creative Commons Attribution Share-Alike",
            
27
  "license_url": "http://www.opendefinition.org/licenses/cc-by-sa",
26
  "license_url": "http://www.opendefinition.org/licenses/cc-by-sa",
            
28
  "maintainer": "Mark Hudson",
27
  "maintainer": "Mark Hudson",
            
29
  "maintainer_email": "hudson@shh.mpg.de",
28
  "maintainer_email": "hudson@shh.mpg.de",
            
30
  "metadata_created": "2021-02-24T14:13:23.047617",
29
  "metadata_created": "2021-02-24T14:13:23.047617",
            
n
31
  "metadata_modified": "2021-06-11T13:23:00.170263",
n
30
  "metadata_modified": "2021-07-31T00:27:46.798796",
            
32
  "name": "archipelago-human-stable-isotope-database",
31
  "name": "archipelago-human-stable-isotope-database",
            
33
  "notes": "The dataset contains human bone and hair carbon and 
32
  "notes": "The dataset contains human bone and hair carbon and 
            
34
nitrogen stable isotopes measurements from Japanese archaeological 
33
nitrogen stable isotopes measurements from Japanese archaeological 
            
35
sites covering the time span from the Upper Palaeolithic to the 
34
sites covering the time span from the Upper Palaeolithic to the 
            
36
mid-nineteenth century. ",
35
mid-nineteenth century. ",
            
37
  "num_resources": 6,
36
  "num_resources": 6,
            
38
  "num_tags": 5,
37
  "num_tags": 5,
            
39
  "organization": {
38
  "organization": {
            
40
    "approval_status": "approved",
39
    "approval_status": "approved",
            
41
    "created": "2021-02-03T17:53:29.162864",
40
    "created": "2021-02-03T17:53:29.162864",
            
42
    "description": "ARCHIPELAGO is an integrated archaeological and 
41
    "description": "ARCHIPELAGO is an integrated archaeological and 
            
43
historical database of land and sea resources utilised by humans in 
42
historical database of land and sea resources utilised by humans in 
            
44
the Japanese Islands. ",
43
the Japanese Islands. ",
            
45
    "id": "bbef4dd3-7e14-4de7-925e-8b2343542130",
44
    "id": "bbef4dd3-7e14-4de7-925e-8b2343542130",
            
46
    "image_url": "2021-02-21-190437.479608logo.png",
45
    "image_url": "2021-02-21-190437.479608logo.png",
            
47
    "is_organization": true,
46
    "is_organization": true,
            
48
    "name": "archipelago",
47
    "name": "archipelago",
            
49
    "state": "active",
48
    "state": "active",
            
50
    "title": "ARCHIPELAGO",
49
    "title": "ARCHIPELAGO",
            
51
    "type": "organization"
50
    "type": "organization"
            
52
  },
51
  },
            
53
  "owner_org": "bbef4dd3-7e14-4de7-925e-8b2343542130",
52
  "owner_org": "bbef4dd3-7e14-4de7-925e-8b2343542130",
            
54
  "private": false,
53
  "private": false,
            
55
  "relationships_as_object": [],
54
  "relationships_as_object": [],
            
56
  "relationships_as_subject": [],
55
  "relationships_as_subject": [],
            
57
  "resources": [
56
  "resources": [
            
58
    {
57
    {
            
59
      "cache_last_updated": null,
58
      "cache_last_updated": null,
            
60
      "cache_url": null,
59
      "cache_url": null,
            
n
61
      "created": "2021-02-24T22:09:19.603156",
n
60
      "created": "2021-05-31T16:28:37.185134",
            
62
      "description": "The data table consists of fields organized into 
61
      "datastore_active": false,
            
63
thematic groups. Each data entry is identified by a unique sequential 
62
      "description": "Version 2 (CSV format) of database for stable 
            
64
key (Entry ID). The data submitter may include additional comments not 
63
isotope measurements for archaeological humans in Japan\r\n\r\nThe 
            
64
data table consists of fields organized into thematic groups. Each 
            
65
data entry is identified by a unique sequential key (Entry_ ID). The 
            
66
data submitter may include additional comments not covered by the 
            
65
covered by the existing fields (Comments), and identify the data 
67
existing fields (Comments), and identify the data submitter by name 
            
66
submitter (ID submitter).\r\n\r\nThe archaeological site and sample 
68
(ID_ submitter).\r\n\r\nThe archaeological site and sample context are 
            
67
context are described in several fields. A site name (Site name), 
69
described in several fields. A site name (Site name), short site 
            
68
short site description (Site description), short description of burial 
70
description of the type of site (Site_ description), short description 
            
69
context (Context description), a context identifier as given in 
71
of burial context (Context description), a context identifier as given 
            
70
publication (Context ID), the name of the locality at which the site 
72
in original publication (Context_ ID), the name of the locality at 
            
71
is located (Locality), of the corresponding region (Region), the site 
73
which the site is located (Locality), of the corresponding region 
            
72
altitude in meters (Altitude), latitude (Latitude) and longitude 
74
(Region), the site altitude in meteres (Altitude), latitude (Latitude) 
            
73
(Longitude) in a WGS84 metric coordinate system, whether the location 
75
and longitude (Longitude) in a WGS84 metric coordinate system, whether 
            
74
of a site could not be exactly established (Exact) and if not the 
76
the location of a site could not be exactly established (Exact) and if 
            
75
range in kilometres within it is expected to be located relative to 
77
not the range in kilometres within it is expected to be located 
            
76
the given coordinates (Radius).\r\n\r\nEach archaeological individual 
78
relative to the given coordinates (Radius).\r\n\r\nEach archaeological 
            
77
from which the sample was taken is identified using the identification 
79
individual from which the sample was taken is identified using the 
            
78
provided in the original publication (Individual ID) followed by a 
80
identification provided in the original publication (Individual ID) 
            
79
short description of the burial (Burial type). Additional sample 
81
followed by a short description of the burial 
            
82
(Burial_type_skeletal_context Burial type). Additional sample 
            
80
description includes taxon (Taxon) and the corresponding name in 
83
description includes taxon (Taxon) and the corresponding name in 
            
n
81
common language (Taxon common name). Our database currently contains 
n
84
common language (Taxon common name). Our database dataset currently 
            
82
only human data but in the future we plan to expand it to include 
85
contains only human data but in the future we plan to expand it to 
            
83
other taxa. Osteological information includes sex identification 
86
include other taxa. Osteological information includes sex 
            
84
(Sex), a text description of age (Age category individual), numeric 
87
identification (Sex), a text description of age (Age_ category_ 
            
85
ranges in years for minimum (Min. age individual) and maximum age 
88
individual), numeric ranges in years for minimum (Min_. age_ 
            
89
individual) and maximum age (Max_. age_ individual) biological age of 
            
86
(Max. age individual), and the type of bone or hair material that 
90
the individual at death, and the type of bone or hair material that 
            
87
sampled from the archaeological individual (sample type).\r\n\r\nThe 
91
sampled from the archaeological individual (Ssample_ 
            
92
type).\r\n\r\nBiological age categories for skeletal individuals 
            
93
followed the published reports. These reports used standard 
            
94
bioarchaeological categories based on dental and skeletal age [24]: 
            
95
infant: birth \u2013 3 years; child: 3- 12 years; adolescent: 12-20 
            
96
years; young adult: 20-35 years; middle adult: 35-50 years; old adult: 
            
97
50 + years. In some cases, particularly with older publications, the 
            
98
ages of these categories may differ slightly. The age > 55 is 
            
99
sometimes used for \u2018older adults\u2019 in the Japanese 
            
100
literature. Cases where the same values are reported for minimum and 
            
101
maximum individual ages represent average estimated age. Some of the 
            
102
studies used here report very precise age estimates for sub-adults. In 
            
103
such cases our dataset follows these estimates, which are derived from 
            
104
different methods described in the studies concerned.\r\n\r\nThe 
            
88
chronological range of the sample is given by a minimum age (Min age 
105
chronological range of the sample is given by a minimum age 
            
89
(95%)) and maximum age (Max age (95%)) in years BC and AD with years 
106
(Min_chronology age (95%)) and maximum age (Max_chronology age (95%)) 
            
90
BC expressed by negative numbers. Age assignment followed a 
107
in years BC and AD with years BC expressed by negative numbers. Age 
            
91
hierarchical approach. Whenever available we employed direct dates 
108
assignment followed a hierarchical approach. Whenever available we 
            
92
from samples (e.g. radiocarbon dates, in which the calibrated 95% 
109
employed direct dates from samples (e.g. radiocarbon dates, in which 
            
93
range is reported) or from coeval samples from the same archaeological 
110
the calibrated 95% range is reported) or from coeval samples from the 
            
94
context. If necessary, corrections for aquatic radiocarbon reservoir 
111
same archaeological context. If necessary, corrections for aquatic 
            
95
effects were applied. If no secure dating was available from the 
112
marine radiocarbon reservoir effects were applied on direct 
            
96
sample context, we employed the site\u2019s chronology given usually 
113
radiocarbon measurements of human bones (see below). A dataset field 
            
97
in the archaeological report. If this was also not available, we 
114
(Dietary_ model_selection) identifies the type of Bayesian model 
            
98
employed the full cultural range to which the sample was assigned. A 
115
employed to estimate the dietary contributions from marine carbon.. If 
            
99
field was used to identify the type of employed dating method (Dating 
116
no secure dating was available from the sample context, we employed 
            
100
method). Also included were fields for uncalibrated direct radiocarbon 
117
the site\u2019s chronology given usually in the archaeological report. 
            
101
dates on sample (14C), its uncertainty (14C unc). Period tags are also 
118
If this was also not available, we employed the full cultural range to 
            
119
which the sample was assigned. A field was used to identify the type 
            
120
of employed dating method (Dating_ method). Also included were fields 
            
121
for uncalibrated direct radiocarbon dates on sample (14C), its 
            
122
uncertainty (14C unc). Period tags are also used to provide 
            
102
used to provide traditional chronological information (Period 
123
traditional chronological information (Period_ 
            
103
tags).\r\n\r\nMeasurements of stable carbon (delta 13C coll) and 
124
tags).\r\n\r\nMeasurements of stable carbon (delta_ 13C_ coll) and 
            
104
nitrogen (delta 15N coll) isotopic ratios in bone collagen and hair 
125
nitrogen (delta_ 15N_ coll) isotopic ratios in bone collagen and hair 
            
105
keratin are reported together with measurements quality indicators, 
126
keratin are reported together with measurements quality indicators, 
            
106
the percentage of elemental carbon (%C), the percentage of elemental 
127
the percentage of elemental carbon (%C), the percentage of elemental 
            
107
nitrogen (%N), the carbon to nitrogen atomic ratio (C/N), and the 
128
nitrogen (%N), the carbon to nitrogen atomic ratio (C/N), and the 
            
n
108
collagen yield for bone samples (Collagen yield).\r\n\r\nA reference 
n
129
collagen yield for bone samples (Collagen_ yield).\r\n\r\nA reference 
            
109
in the format author(s)/year of publication/title identified the 
130
in the format author(s)/year of publication/title identified the 
            
110
source publication or publications from where the data was collected 
131
source publication or publications from where the data was collected 
            
111
(Reference), in addition to a link to the publication whenever 
132
(Reference), in addition to a link to the publication whenever 
            
n
112
available (Link), a DOI (DOI), and the publication date or dates 
n
133
available (Link), a Digital object identifier as a persistent 
            
134
identifier DOI (DOI), and the publication date or dates (Publication_ 
            
113
(Publication date). Macrons were not used for Japanese titles in the 
135
date). Macrons were not used for Japanese titles in the list.",
            
114
list.\r\n",

            
115
      "format": "CSV",
136
      "format": "CSV",
            
116
      "hash": "",
137
      "hash": "",
            
n
117
      "id": "971c397a-1806-4b59-97e1-0915dab25428",
n
138
      "id": "75920f42-db23-4d72-b7c8-40a51355c859",
            
118
      "last_modified": "2021-02-25T12:00:37.011370",
139
      "last_modified": "2021-06-11T13:21:09.504925",
            
119
      "metadata_modified": "2021-02-25T12:00:37.022584",
140
      "metadata_modified": "2021-07-31T00:27:46.802724",
            
120
      "mimetype": "text/csv",
141
      "mimetype": "text/csv",
            
121
      "mimetype_inner": null,
142
      "mimetype_inner": null,
            
122
      "name": "Stable isotope measurements for archaeological humans 
143
      "name": "Stable isotope measurements for archaeological humans 
            
n
123
in Japan",
n
144
in Japan v. 2 (CSV)",
            
124
      "package_id": "8378ee13-0cb9-4fec-95aa-d64f52d21fd0",
145
      "package_id": "8378ee13-0cb9-4fec-95aa-d64f52d21fd0",
            
125
      "position": 0,
146
      "position": 0,
            
126
      "resource_type": null,
147
      "resource_type": null,
            
n
127
      "size": 799850,
n
148
      "size": 1608122,
            
128
      "state": "active",
149
      "state": "active",
            
129
      "url": 
150
      "url": 
            
n
130
71c397a-1806-4b59-97e1-0915dab25428/download/japan-human-si-data.csv",
n
151
0f42-db23-4d72-b7c8-40a51355c859/download/japan-human-si-data-v2.csv",
            
131
      "url_type": "upload"
152
      "url_type": "upload"
            
132
    },
153
    },
            
133
    {
154
    {
            
134
      "cache_last_updated": null,
155
      "cache_last_updated": null,
            
135
      "cache_url": null,
156
      "cache_url": null,
            
136
      "created": "2021-05-26T18:05:45.096083",
157
      "created": "2021-05-26T18:05:45.096083",
            
n
n
158
      "datastore_active": false,
            
137
      "description": "Version 2 (Excel format) of database for stable 
159
      "description": "Version 2 (Excel format) of database for stable 
            
138
isotope measurements for archaeological humans in Japan\r\n\r\nThe 
160
isotope measurements for archaeological humans in Japan\r\n\r\nThe 
            
139
data table consists of fields organized into thematic groups. Each 
161
data table consists of fields organized into thematic groups. Each 
            
140
data entry is identified by a unique sequential key (Entry_ ID). The 
162
data entry is identified by a unique sequential key (Entry_ ID). The 
            
141
data submitter may include additional comments not covered by the 
163
data submitter may include additional comments not covered by the 
            
142
existing fields (Comments), and identify the data submitter by name 
164
existing fields (Comments), and identify the data submitter by name 
            
143
(ID_ submitter).\r\n\r\nThe archaeological site and sample context are 
165
(ID_ submitter).\r\n\r\nThe archaeological site and sample context are 
            
144
described in several fields. A site name (Site name), short site 
166
described in several fields. A site name (Site name), short site 
            
145
description of the type of site (Site_ description), short description 
167
description of the type of site (Site_ description), short description 
            
146
of burial context (Context description), a context identifier as given 
168
of burial context (Context description), a context identifier as given 
            
147
in original publication (Context_ ID), the name of the locality at 
169
in original publication (Context_ ID), the name of the locality at 
            
148
which the site is located (Locality), of the corresponding region 
170
which the site is located (Locality), of the corresponding region 
            
149
(Region), the site altitude in meteres (Altitude), latitude (Latitude) 
171
(Region), the site altitude in meteres (Altitude), latitude (Latitude) 
            
150
and longitude (Longitude) in a WGS84 metric coordinate system, whether 
172
and longitude (Longitude) in a WGS84 metric coordinate system, whether 
            
151
the location of a site could not be exactly established (Exact) and if 
173
the location of a site could not be exactly established (Exact) and if 
            
152
not the range in kilometres within it is expected to be located 
174
not the range in kilometres within it is expected to be located 
            
153
relative to the given coordinates (Radius).\r\n\r\nEach archaeological 
175
relative to the given coordinates (Radius).\r\n\r\nEach archaeological 
            
154
individual from which the sample was taken is identified using the 
176
individual from which the sample was taken is identified using the 
            
155
identification provided in the original publication (Individual ID) 
177
identification provided in the original publication (Individual ID) 
            
156
followed by a short description of the burial 
178
followed by a short description of the burial 
            
157
(Burial_type_skeletal_context Burial type). Additional sample 
179
(Burial_type_skeletal_context Burial type). Additional sample 
            
158
description includes taxon (Taxon) and the corresponding name in 
180
description includes taxon (Taxon) and the corresponding name in 
            
159
common language (Taxon common name). Our database dataset currently 
181
common language (Taxon common name). Our database dataset currently 
            
160
contains only human data but in the future we plan to expand it to 
182
contains only human data but in the future we plan to expand it to 
            
161
include other taxa. Osteological information includes sex 
183
include other taxa. Osteological information includes sex 
            
162
identification (Sex), a text description of age (Age_ category_ 
184
identification (Sex), a text description of age (Age_ category_ 
            
163
individual), numeric ranges in years for minimum (Min_. age_ 
185
individual), numeric ranges in years for minimum (Min_. age_ 
            
164
individual) and maximum age (Max_. age_ individual) biological age of 
186
individual) and maximum age (Max_. age_ individual) biological age of 
            
165
the individual at death, and the type of bone or hair material that 
187
the individual at death, and the type of bone or hair material that 
            
166
sampled from the archaeological individual (Ssample_ 
188
sampled from the archaeological individual (Ssample_ 
            
167
type).\r\n\r\nBiological age categories for skeletal individuals 
189
type).\r\n\r\nBiological age categories for skeletal individuals 
            
168
followed the published reports. These reports used standard 
190
followed the published reports. These reports used standard 
            
169
bioarchaeological categories based on dental and skeletal age [24]: 
191
bioarchaeological categories based on dental and skeletal age [24]: 
            
170
infant: birth \u2013 3 years; child: 3- 12 years; adolescent: 12-20 
192
infant: birth \u2013 3 years; child: 3- 12 years; adolescent: 12-20 
            
171
years; young adult: 20-35 years; middle adult: 35-50 years; old adult: 
193
years; young adult: 20-35 years; middle adult: 35-50 years; old adult: 
            
172
50 + years. In some cases, particularly with older publications, the 
194
50 + years. In some cases, particularly with older publications, the 
            
173
ages of these categories may differ slightly. The age > 55 is 
195
ages of these categories may differ slightly. The age > 55 is 
            
174
sometimes used for \u2018older adults\u2019 in the Japanese 
196
sometimes used for \u2018older adults\u2019 in the Japanese 
            
175
literature. Cases where the same values are reported for minimum and 
197
literature. Cases where the same values are reported for minimum and 
            
176
maximum individual ages represent average estimated age. Some of the 
198
maximum individual ages represent average estimated age. Some of the 
            
177
studies used here report very precise age estimates for sub-adults. In 
199
studies used here report very precise age estimates for sub-adults. In 
            
178
such cases our dataset follows these estimates, which are derived from 
200
such cases our dataset follows these estimates, which are derived from 
            
179
different methods described in the studies concerned.\r\n\r\nThe 
201
different methods described in the studies concerned.\r\n\r\nThe 
            
180
chronological range of the sample is given by a minimum age 
202
chronological range of the sample is given by a minimum age 
            
181
(Min_chronology age (95%)) and maximum age (Max_chronology age (95%)) 
203
(Min_chronology age (95%)) and maximum age (Max_chronology age (95%)) 
            
182
in years BC and AD with years BC expressed by negative numbers. Age 
204
in years BC and AD with years BC expressed by negative numbers. Age 
            
183
assignment followed a hierarchical approach. Whenever available we 
205
assignment followed a hierarchical approach. Whenever available we 
            
184
employed direct dates from samples (e.g. radiocarbon dates, in which 
206
employed direct dates from samples (e.g. radiocarbon dates, in which 
            
185
the calibrated 95% range is reported) or from coeval samples from the 
207
the calibrated 95% range is reported) or from coeval samples from the 
            
186
same archaeological context. If necessary, corrections for aquatic 
208
same archaeological context. If necessary, corrections for aquatic 
            
187
marine radiocarbon reservoir effects were applied on direct 
209
marine radiocarbon reservoir effects were applied on direct 
            
188
radiocarbon measurements of human bones (see below). A dataset field 
210
radiocarbon measurements of human bones (see below). A dataset field 
            
189
(Dietary_ model_selection) identifies the type of Bayesian model 
211
(Dietary_ model_selection) identifies the type of Bayesian model 
            
190
employed to estimate the dietary contributions from marine carbon.. If 
212
employed to estimate the dietary contributions from marine carbon.. If 
            
191
no secure dating was available from the sample context, we employed 
213
no secure dating was available from the sample context, we employed 
            
192
the site\u2019s chronology given usually in the archaeological report. 
214
the site\u2019s chronology given usually in the archaeological report. 
            
193
If this was also not available, we employed the full cultural range to 
215
If this was also not available, we employed the full cultural range to 
            
194
which the sample was assigned. A field was used to identify the type 
216
which the sample was assigned. A field was used to identify the type 
            
195
of employed dating method (Dating_ method). Also included were fields 
217
of employed dating method (Dating_ method). Also included were fields 
            
196
for uncalibrated direct radiocarbon dates on sample (14C), its 
218
for uncalibrated direct radiocarbon dates on sample (14C), its 
            
197
uncertainty (14C unc). Period tags are also used to provide 
219
uncertainty (14C unc). Period tags are also used to provide 
            
198
traditional chronological information (Period_ 
220
traditional chronological information (Period_ 
            
199
tags).\r\n\r\nMeasurements of stable carbon (delta_ 13C_ coll) and 
221
tags).\r\n\r\nMeasurements of stable carbon (delta_ 13C_ coll) and 
            
200
nitrogen (delta_ 15N_ coll) isotopic ratios in bone collagen and hair 
222
nitrogen (delta_ 15N_ coll) isotopic ratios in bone collagen and hair 
            
201
keratin are reported together with measurements quality indicators, 
223
keratin are reported together with measurements quality indicators, 
            
202
the percentage of elemental carbon (%C), the percentage of elemental 
224
the percentage of elemental carbon (%C), the percentage of elemental 
            
203
nitrogen (%N), the carbon to nitrogen atomic ratio (C/N), and the 
225
nitrogen (%N), the carbon to nitrogen atomic ratio (C/N), and the 
            
204
collagen yield for bone samples (Collagen_ yield).\r\n\r\nA reference 
226
collagen yield for bone samples (Collagen_ yield).\r\n\r\nA reference 
            
205
in the format author(s)/year of publication/title identified the 
227
in the format author(s)/year of publication/title identified the 
            
206
source publication or publications from where the data was collected 
228
source publication or publications from where the data was collected 
            
207
(Reference), in addition to a link to the publication whenever 
229
(Reference), in addition to a link to the publication whenever 
            
208
available (Link), a Digital object identifier as a persistent 
230
available (Link), a Digital object identifier as a persistent 
            
209
identifier DOI (DOI), and the publication date or dates (Publication_ 
231
identifier DOI (DOI), and the publication date or dates (Publication_ 
            
210
date). Macrons were not used for Japanese titles in the list.",
232
date). Macrons were not used for Japanese titles in the list.",
            
211
      "format": "XLSX",
233
      "format": "XLSX",
            
212
      "hash": "",
234
      "hash": "",
            
213
      "id": "b147d214-b60f-4bb4-af6c-5bde3eefffeb",
235
      "id": "b147d214-b60f-4bb4-af6c-5bde3eefffeb",
            
214
      "last_modified": "2021-06-11T13:23:00.136588",
236
      "last_modified": "2021-06-11T13:23:00.136588",
            
n
215
      "metadata_modified": "2021-06-11T13:23:00.175327",
n
237
      "metadata_modified": "2021-07-31T00:27:46.802888",
            
216
      "mimetype": 
238
      "mimetype": 
            
217
"application/vnd.openxmlformats-officedocument.spreadsheetml.sheet",
239
"application/vnd.openxmlformats-officedocument.spreadsheetml.sheet",
            
218
      "mimetype_inner": null,
240
      "mimetype_inner": null,
            
219
      "name": "Stable isotope measurements for archaeological humans 
241
      "name": "Stable isotope measurements for archaeological humans 
            
220
in Japan v. 2 (Excel)",
242
in Japan v. 2 (Excel)",
            
221
      "package_id": "8378ee13-0cb9-4fec-95aa-d64f52d21fd0",
243
      "package_id": "8378ee13-0cb9-4fec-95aa-d64f52d21fd0",
            
222
      "position": 1,
244
      "position": 1,
            
223
      "resource_type": null,
245
      "resource_type": null,
            
224
      "size": 279118,
246
      "size": 279118,
            
225
      "state": "active",
247
      "state": "active",
            
226
      "url": 
248
      "url": 
            
227
214-b60f-4bb4-af6c-5bde3eefffeb/download/japan-human-si-data-v2.xlsx",
249
214-b60f-4bb4-af6c-5bde3eefffeb/download/japan-human-si-data-v2.xlsx",
            
228
      "url_type": "upload"
250
      "url_type": "upload"
            
229
    },
251
    },
            
230
    {
252
    {
            
231
      "cache_last_updated": null,
253
      "cache_last_updated": null,
            
232
      "cache_url": null,
254
      "cache_url": null,
            
n
233
      "created": "2021-05-31T16:28:37.185134",
n
255
      "created": "2021-02-24T22:09:19.603156",
            
234
      "description": "Version 2 (CSV format) of database for stable 
256
      "datastore_active": false,
            
235
isotope measurements for archaeological humans in Japan\r\n\r\nThe 
257
      "description": "The data table consists of fields organized into 
            
236
data table consists of fields organized into thematic groups. Each 
258
thematic groups. Each data entry is identified by a unique sequential 
            
237
data entry is identified by a unique sequential key (Entry_ ID). The 
259
key (Entry ID). The data submitter may include additional comments not 
            
238
data submitter may include additional comments not covered by the 

            
239
existing fields (Comments), and identify the data submitter by name 
260
covered by the existing fields (Comments), and identify the data 
            
240
(ID_ submitter).\r\n\r\nThe archaeological site and sample context are 
261
submitter (ID submitter).\r\n\r\nThe archaeological site and sample 
            
241
described in several fields. A site name (Site name), short site 
262
context are described in several fields. A site name (Site name), 
            
242
description of the type of site (Site_ description), short description 
263
short site description (Site description), short description of burial 
            
243
of burial context (Context description), a context identifier as given 
264
context (Context description), a context identifier as given in 
            
244
in original publication (Context_ ID), the name of the locality at 
265
publication (Context ID), the name of the locality at which the site 
            
245
which the site is located (Locality), of the corresponding region 
266
is located (Locality), of the corresponding region (Region), the site 
            
246
(Region), the site altitude in meteres (Altitude), latitude (Latitude) 
267
altitude in meters (Altitude), latitude (Latitude) and longitude 
            
247
and longitude (Longitude) in a WGS84 metric coordinate system, whether 
268
(Longitude) in a WGS84 metric coordinate system, whether the location 
            
248
the location of a site could not be exactly established (Exact) and if 
269
of a site could not be exactly established (Exact) and if not the 
            
249
not the range in kilometres within it is expected to be located 
270
range in kilometres within it is expected to be located relative to 
            
250
relative to the given coordinates (Radius).\r\n\r\nEach archaeological 
271
the given coordinates (Radius).\r\n\r\nEach archaeological individual 
            
251
individual from which the sample was taken is identified using the 
272
from which the sample was taken is identified using the identification 
            
252
identification provided in the original publication (Individual ID) 
273
provided in the original publication (Individual ID) followed by a 
            
253
followed by a short description of the burial 
274
short description of the burial (Burial type). Additional sample 
            
254
(Burial_type_skeletal_context Burial type). Additional sample 

            
255
description includes taxon (Taxon) and the corresponding name in 
275
description includes taxon (Taxon) and the corresponding name in 
            
n
256
common language (Taxon common name). Our database dataset currently 
n
276
common language (Taxon common name). Our database currently contains 
            
257
contains only human data but in the future we plan to expand it to 
277
only human data but in the future we plan to expand it to include 
            
258
include other taxa. Osteological information includes sex 
278
other taxa. Osteological information includes sex identification 
            
259
identification (Sex), a text description of age (Age_ category_ 
279
(Sex), a text description of age (Age category individual), numeric 
            
260
individual), numeric ranges in years for minimum (Min_. age_ 
280
ranges in years for minimum (Min. age individual) and maximum age 
            
261
individual) and maximum age (Max_. age_ individual) biological age of 

            
262
the individual at death, and the type of bone or hair material that 
281
(Max. age individual), and the type of bone or hair material that 
            
263
sampled from the archaeological individual (Ssample_ 
282
sampled from the archaeological individual (sample type).\r\n\r\nThe 
            
264
type).\r\n\r\nBiological age categories for skeletal individuals 

            
265
followed the published reports. These reports used standard 

            
266
bioarchaeological categories based on dental and skeletal age [24]: 

            
267
infant: birth \u2013 3 years; child: 3- 12 years; adolescent: 12-20 

            
268
years; young adult: 20-35 years; middle adult: 35-50 years; old adult: 

            
269
50 + years. In some cases, particularly with older publications, the 

            
270
ages of these categories may differ slightly. The age > 55 is 

            
271
sometimes used for \u2018older adults\u2019 in the Japanese 

            
272
literature. Cases where the same values are reported for minimum and 

            
273
maximum individual ages represent average estimated age. Some of the 

            
274
studies used here report very precise age estimates for sub-adults. In 

            
275
such cases our dataset follows these estimates, which are derived from 

            
276
different methods described in the studies concerned.\r\n\r\nThe 

            
277
chronological range of the sample is given by a minimum age 
283
chronological range of the sample is given by a minimum age (Min age 
            
278
(Min_chronology age (95%)) and maximum age (Max_chronology age (95%)) 
284
(95%)) and maximum age (Max age (95%)) in years BC and AD with years 
            
279
in years BC and AD with years BC expressed by negative numbers. Age 
285
BC expressed by negative numbers. Age assignment followed a 
            
280
assignment followed a hierarchical approach. Whenever available we 
286
hierarchical approach. Whenever available we employed direct dates 
            
281
employed direct dates from samples (e.g. radiocarbon dates, in which 
287
from samples (e.g. radiocarbon dates, in which the calibrated 95% 
            
282
the calibrated 95% range is reported) or from coeval samples from the 
288
range is reported) or from coeval samples from the same archaeological 
            
283
same archaeological context. If necessary, corrections for aquatic 
289
context. If necessary, corrections for aquatic radiocarbon reservoir 
            
284
marine radiocarbon reservoir effects were applied on direct 
290
effects were applied. If no secure dating was available from the 
            
285
radiocarbon measurements of human bones (see below). A dataset field 
291
sample context, we employed the site\u2019s chronology given usually 
            
286
(Dietary_ model_selection) identifies the type of Bayesian model 
292
in the archaeological report. If this was also not available, we 
            
287
employed to estimate the dietary contributions from marine carbon.. If 
293
employed the full cultural range to which the sample was assigned. A 
            
288
no secure dating was available from the sample context, we employed 
294
field was used to identify the type of employed dating method (Dating 
            
289
the site\u2019s chronology given usually in the archaeological report. 
295
method). Also included were fields for uncalibrated direct radiocarbon 
            
290
If this was also not available, we employed the full cultural range to 
296
dates on sample (14C), its uncertainty (14C unc). Period tags are also 
            
291
which the sample was assigned. A field was used to identify the type 

            
292
of employed dating method (Dating_ method). Also included were fields 

            
293
for uncalibrated direct radiocarbon dates on sample (14C), its 

            
294
uncertainty (14C unc). Period tags are also used to provide 

            
295
traditional chronological information (Period_ 
297
used to provide traditional chronological information (Period 
            
296
tags).\r\n\r\nMeasurements of stable carbon (delta_ 13C_ coll) and 
298
tags).\r\n\r\nMeasurements of stable carbon (delta 13C coll) and 
            
297
nitrogen (delta_ 15N_ coll) isotopic ratios in bone collagen and hair 
299
nitrogen (delta 15N coll) isotopic ratios in bone collagen and hair 
            
298
keratin are reported together with measurements quality indicators, 
300
keratin are reported together with measurements quality indicators, 
            
299
the percentage of elemental carbon (%C), the percentage of elemental 
301
the percentage of elemental carbon (%C), the percentage of elemental 
            
300
nitrogen (%N), the carbon to nitrogen atomic ratio (C/N), and the 
302
nitrogen (%N), the carbon to nitrogen atomic ratio (C/N), and the 
            
n
301
collagen yield for bone samples (Collagen_ yield).\r\n\r\nA reference 
n
303
collagen yield for bone samples (Collagen yield).\r\n\r\nA reference 
            
302
in the format author(s)/year of publication/title identified the 
304
in the format author(s)/year of publication/title identified the 
            
303
source publication or publications from where the data was collected 
305
source publication or publications from where the data was collected 
            
304
(Reference), in addition to a link to the publication whenever 
306
(Reference), in addition to a link to the publication whenever 
            
n
305
available (Link), a Digital object identifier as a persistent 
n
307
available (Link), a DOI (DOI), and the publication date or dates 
            
306
identifier DOI (DOI), and the publication date or dates (Publication_ 

            
307
date). Macrons were not used for Japanese titles in the list.",
308
(Publication date). Macrons were not used for Japanese titles in the 
            
309
list.\r\n",
            
308
      "format": "CSV",
310
      "format": "CSV",
            
309
      "hash": "",
311
      "hash": "",
            
n
310
      "id": "75920f42-db23-4d72-b7c8-40a51355c859",
n
312
      "id": "971c397a-1806-4b59-97e1-0915dab25428",
            
311
      "last_modified": "2021-06-11T13:21:09.504925",
313
      "last_modified": "2021-02-25T12:00:37.011370",
            
312
      "metadata_modified": "2021-06-11T13:21:09.545004",
314
      "metadata_modified": "2021-07-31T00:27:46.803018",
            
313
      "mimetype": "text/csv",
315
      "mimetype": "text/csv",
            
314
      "mimetype_inner": null,
316
      "mimetype_inner": null,
            
315
      "name": "Stable isotope measurements for archaeological humans 
317
      "name": "Stable isotope measurements for archaeological humans 
            
n
316
in Japan v. 2 (CSV)",
n
318
in Japan",
            
317
      "package_id": "8378ee13-0cb9-4fec-95aa-d64f52d21fd0",
319
      "package_id": "8378ee13-0cb9-4fec-95aa-d64f52d21fd0",
            
318
      "position": 2,
320
      "position": 2,
            
319
      "resource_type": null,
321
      "resource_type": null,
            
n
320
      "size": 1608122,
n
322
      "size": 799850,
            
321
      "state": "active",
323
      "state": "active",
            
322
      "url": 
324
      "url": 
            
n
323
0f42-db23-4d72-b7c8-40a51355c859/download/japan-human-si-data-v2.csv",
n
325
71c397a-1806-4b59-97e1-0915dab25428/download/japan-human-si-data.csv",
            
324
      "url_type": "upload"
326
      "url_type": "upload"
            
325
    },
327
    },
            
326
    {
328
    {
            
327
      "cache_last_updated": null,
329
      "cache_last_updated": null,
            
328
      "cache_url": null,
330
      "cache_url": null,
            
329
      "created": "2021-05-31T16:52:19.795549",
331
      "created": "2021-05-31T16:52:19.795549",
            
n
n
332
      "datastore_active": false,
            
330
      "description": "Dietary model 1 employed for dietary estimates 
333
      "description": "Dietary model 1 employed for dietary estimates 
            
331
of marine carbon contributions and radiocarbon marine reservoir effect 
334
of marine carbon contributions and radiocarbon marine reservoir effect 
            
332
corrections.",
335
corrections.",
            
333
      "format": ".RData",
336
      "format": ".RData",
            
334
      "hash": "",
337
      "hash": "",
            
335
      "id": "6b6148f5-660d-4aee-a47d-5cdf4d8a8479",
338
      "id": "6b6148f5-660d-4aee-a47d-5cdf4d8a8479",
            
336
      "last_modified": "2021-05-31T16:52:19.751264",
339
      "last_modified": "2021-05-31T16:52:19.751264",
            
n
337
      "metadata_modified": "2021-05-31T16:52:19.782031",
n
340
      "metadata_modified": "2021-07-31T00:27:46.803142",
            
338
      "mimetype": null,
341
      "mimetype": null,
            
339
      "mimetype_inner": null,
342
      "mimetype_inner": null,
            
340
      "name": "ReSources dietary model 1",
343
      "name": "ReSources dietary model 1",
            
341
      "package_id": "8378ee13-0cb9-4fec-95aa-d64f52d21fd0",
344
      "package_id": "8378ee13-0cb9-4fec-95aa-d64f52d21fd0",
            
342
      "position": 3,
345
      "position": 3,
            
343
      "resource_type": null,
346
      "resource_type": null,
            
344
      "size": 1877,
347
      "size": 1877,
            
345
      "state": "active",
348
      "state": "active",
            
346
      "url": 
349
      "url": 
            
347
resource/6b6148f5-660d-4aee-a47d-5cdf4d8a8479/download/model-1.rdata",
350
resource/6b6148f5-660d-4aee-a47d-5cdf4d8a8479/download/model-1.rdata",
            
348
      "url_type": "upload"
351
      "url_type": "upload"
            
349
    },
352
    },
            
350
    {
353
    {
            
351
      "cache_last_updated": null,
354
      "cache_last_updated": null,
            
352
      "cache_url": null,
355
      "cache_url": null,
            
353
      "created": "2021-05-31T16:53:38.996760",
356
      "created": "2021-05-31T16:53:38.996760",
            
n
n
357
      "datastore_active": false,
            
354
      "description": "Dietary model 2 employed for dietary estimates 
358
      "description": "Dietary model 2 employed for dietary estimates 
            
355
of marine carbon contributions and radiocarbon marine reservoir effect 
359
of marine carbon contributions and radiocarbon marine reservoir effect 
            
356
corrections.",
360
corrections.",
            
357
      "format": ".RData",
361
      "format": ".RData",
            
358
      "hash": "",
362
      "hash": "",
            
359
      "id": "6f7ffed7-5eb7-4969-9608-e45af66f59fb",
363
      "id": "6f7ffed7-5eb7-4969-9608-e45af66f59fb",
            
360
      "last_modified": "2021-05-31T16:53:38.949200",
364
      "last_modified": "2021-05-31T16:53:38.949200",
            
n
361
      "metadata_modified": "2021-05-31T16:53:38.982671",
n
365
      "metadata_modified": "2021-07-31T00:27:46.803370",
            
362
      "mimetype": null,
366
      "mimetype": null,
            
363
      "mimetype_inner": null,
367
      "mimetype_inner": null,
            
364
      "name": "ReSources dietary model 2",
368
      "name": "ReSources dietary model 2",
            
365
      "package_id": "8378ee13-0cb9-4fec-95aa-d64f52d21fd0",
369
      "package_id": "8378ee13-0cb9-4fec-95aa-d64f52d21fd0",
            
366
      "position": 4,
370
      "position": 4,
            
367
      "resource_type": null,
371
      "resource_type": null,
            
368
      "size": 14219,
372
      "size": 14219,
            
369
      "state": "active",
373
      "state": "active",
            
370
      "url": 
374
      "url": 
            
371
resource/6f7ffed7-5eb7-4969-9608-e45af66f59fb/download/model-2.rdata",
375
resource/6f7ffed7-5eb7-4969-9608-e45af66f59fb/download/model-2.rdata",
            
372
      "url_type": "upload"
376
      "url_type": "upload"
            
373
    },
377
    },
            
374
    {
378
    {
            
375
      "cache_last_updated": null,
379
      "cache_last_updated": null,
            
376
      "cache_url": null,
380
      "cache_url": null,
            
377
      "created": "2021-05-31T16:54:33.712570",
381
      "created": "2021-05-31T16:54:33.712570",
            
n
n
382
      "datastore_active": false,
            
378
      "description": "Dietary model 3 employed for dietary estimates 
383
      "description": "Dietary model 3 employed for dietary estimates 
            
379
of marine carbon contributions and radiocarbon marine reservoir effect 
384
of marine carbon contributions and radiocarbon marine reservoir effect 
            
380
corrections.\r\n",
385
corrections.\r\n",
            
381
      "format": ".RData",
386
      "format": ".RData",
            
382
      "hash": "",
387
      "hash": "",
            
383
      "id": "0b559302-6562-4a1e-a914-bab1188f1cca",
388
      "id": "0b559302-6562-4a1e-a914-bab1188f1cca",
            
384
      "last_modified": "2021-05-31T16:54:33.665862",
389
      "last_modified": "2021-05-31T16:54:33.665862",
            
t
385
      "metadata_modified": "2021-05-31T16:54:33.698389",
t
390
      "metadata_modified": "2021-07-31T00:27:46.803513",
            
386
      "mimetype": null,
391
      "mimetype": null,
            
387
      "mimetype_inner": null,
392
      "mimetype_inner": null,
            
388
      "name": "ReSources dietary model 1",
393
      "name": "ReSources dietary model 1",
            
389
      "package_id": "8378ee13-0cb9-4fec-95aa-d64f52d21fd0",
394
      "package_id": "8378ee13-0cb9-4fec-95aa-d64f52d21fd0",
            
390
      "position": 5,
395
      "position": 5,
            
391
      "resource_type": null,
396
      "resource_type": null,
            
392
      "size": 17526,
397
      "size": 17526,
            
393
      "state": "active",
398
      "state": "active",
            
394
      "url": 
399
      "url": 
            
395
resource/0b559302-6562-4a1e-a914-bab1188f1cca/download/model-3.rdata",
400
resource/0b559302-6562-4a1e-a914-bab1188f1cca/download/model-3.rdata",
            
396
      "url_type": "upload"
401
      "url_type": "upload"
            
397
    }
402
    }
            
398
  ],
403
  ],
            
399
  "state": "active",
404
  "state": "active",
            
400
  "tags": [
405
  "tags": [
            
401
    {
406
    {
            
402
      "display_name": "Archaeology",
407
      "display_name": "Archaeology",
            
403
      "id": "added2c9-60e3-4991-bea0-38241d803b73",
408
      "id": "added2c9-60e3-4991-bea0-38241d803b73",
            
404
      "name": "Archaeology",
409
      "name": "Archaeology",
            
405
      "state": "active",
410
      "state": "active",
            
406
      "vocabulary_id": null
411
      "vocabulary_id": null
            
407
    },
412
    },
            
408
    {
413
    {
            
409
      "display_name": "Database",
414
      "display_name": "Database",
            
410
      "id": "e36afad0-91c1-4df0-966e-8bdda7d5ffb0",
415
      "id": "e36afad0-91c1-4df0-966e-8bdda7d5ffb0",
            
411
      "name": "Database",
416
      "name": "Database",
            
412
      "state": "active",
417
      "state": "active",
            
413
      "vocabulary_id": null
418
      "vocabulary_id": null
            
414
    },
419
    },
            
415
    {
420
    {
            
416
      "display_name": "Diet",
421
      "display_name": "Diet",
            
417
      "id": "b0efb573-f810-4312-8b3b-38fb46804eef",
422
      "id": "b0efb573-f810-4312-8b3b-38fb46804eef",
            
418
      "name": "Diet",
423
      "name": "Diet",
            
419
      "state": "active",
424
      "state": "active",
            
420
      "vocabulary_id": null
425
      "vocabulary_id": null
            
421
    },
426
    },
            
422
    {
427
    {
            
423
      "display_name": "Japan",
428
      "display_name": "Japan",
            
424
      "id": "17fe52f9-59d3-434b-97f2-1289242442cc",
429
      "id": "17fe52f9-59d3-434b-97f2-1289242442cc",
            
425
      "name": "Japan",
430
      "name": "Japan",
            
426
      "state": "active",
431
      "state": "active",
            
427
      "vocabulary_id": null
432
      "vocabulary_id": null
            
428
    },
433
    },
            
429
    {
434
    {
            
430
      "display_name": "Stable isotopes",
435
      "display_name": "Stable isotopes",
            
431
      "id": "3519702f-70f2-4d36-acb2-9c02bb24c492",
436
      "id": "3519702f-70f2-4d36-acb2-9c02bb24c492",
            
432
      "name": "Stable isotopes",
437
      "name": "Stable isotopes",
            
433
      "state": "active",
438
      "state": "active",
            
434
      "vocabulary_id": null
439
      "vocabulary_id": null
            
435
    }
440
    }
            
436
  ],
441
  ],
            
437
  "temporal_end": "1868",
442
  "temporal_end": "1868",
            
438
  "temporal_start": "-20000",
443
  "temporal_start": "-20000",
            
439
  "title": "ARCHIPELAGO human stable isotope database",
444
  "title": "ARCHIPELAGO human stable isotope database",
            
440
  "type": "dataset",
445
  "type": "dataset",
            
441
  "url": null,
446
  "url": null,
            
442
  "version": ""
447
  "version": ""
            
443
}
448
}